La guerra aveva ridotto il Giappone a zero. Godzilla lo ha fatto precipitare sotto zero. Da allora sono passati due anni, durante i quali il Paese ha lottato duramente per risollevarsi e riconquistare finalmente la propria quotidianità. Proprio quando l'umanità sembrava essersi aggrappata a una pace conquistata a caro prezzo, una nuova minaccia colpisce spazzando via ogni speranza in un istante. Non ci sarà una terza volta. Tutto finisce qui.