SpongeBob und seine Freunde aus Bikini Bottom stechen in ihr größtes, neuestes und aufregendstes Kinoabenteuer aller Zeiten. Angetrieben vom Wunsch, allen - vor allem Mr. Krabs - zu beweisen, dass in ihm das Herz eines echten Helden schlägt, begibt sich SpongeBob auf die Spur des Fliegenden Holländers, eines legendären Geisterpiraten. So beginnt ein Abenteuer voller Monster, Piraten und Lacher, das ihn in die dunkelsten Tiefen des Ozeans zieht ... dorthin, wo noch nie zuvor ein Schwamm einen Fuß gesetzt hat.